
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究后果
研究方案员研究性日期推移冷冻箱日期缩短牛羊肉的坚硬程度、持水、色调、存在铁份量、ROS、脂质过防氧化物质、MDA、GSH和GPX4品质来评定肌群聚集細胞的铁去世的情况。后果信息显示,冷冻箱日期缩短后,牛羊肉的坚硬程度在第3天和第6天偏态减少;持水功能削减;背景色变深,失去了色泽,鲜粉大红色转化成暗粉大红色。不仅如此,存在铁、特异性氧和MDA的份量偏态加剧,細胞凋亡率偏态上升。 探讨者提炼区别冷冻箱时长的腹肌备样管理的核血清,而后实行SDS-PAGE浅析,核血清条带在区别期间分布不均不均且形似(图1a)。只能根据核血清在区别备样管理中的体现的情况,浅析找到一个组备样管理的中个数类似于一个平均水平(图1b),情况说明腹肌备样管理核血清都具有好的的组内形似性和组间区别性。 核脂肪酸组学共技术评定出1996种核脂肪酸。以B0为对应组,建立B1、B2、B4和B6中的核核苷酸去差别传达剖析,共技术评定到376个DEPs。将火山图交互式,并给出FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个规定剖析DEP。导致如下图1c-f如图是,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别技术评定出22、33、73和140个DEPs,当中分头别上涨6、11、32和83个,再降16、22、41和54个。聚类分析法的办法评价了不一冷藏箱时期身体脂肪组织开展中核脂肪酸的传达,导致信息显示身体脂肪核核苷酸传达差别由于存放时长的上升而上升(图1g)。
图1| 多种要在冷藏室保存事件的肩部肌肉打样定制核胆固醇组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 多种冷藏箱时光的腹肌打样定制差别蛋清了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁阵亡蛋白质肽的PRM化学发光法剖析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG丰度异同表达出来蛋白质的铁死掉规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT化学发光法核球蛋白组学技巧售后服务性,拜谱菌物已生产研发来完成并创立了不断完善成长的转录组学、核球蛋白组学、排泄组学以其几组学协力护肤品技巧售后服务性系统,欢迎致电咨询!
参考资料文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.