
近日,苏州医科一本大学首个附属医疗医疗王学浩中科院院士创业团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向治疗能量场新陈代谢检测分析服务。
英文翻译大标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名网站标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
老客户方:南京医科大学
分析的材料:细胞
拜谱展示 服务性:转录组测序+淀粉酶互作组+靶点能力基础代谢组
水平规划:
分析結果
01、YBX1被认定为HCC中糖酵解的核心染色体
本学习采样HCC肺部肿癌范本(n=7)的单受损体内部RNA测序数值集做好浅析,会发现糖酵解几丁质酶重点密集在肺部肿癌受损体内部中,hdWGCNA浅析识别图片出9个dna包块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的生活工作浅析确定好YBX1为独特生活工作风险性方面(图1H)。进一部紧密联系IHC、WB检测和肺部肿癌集体与临近非肺部肿癌集体的地方转录组学数值集断定YBX1是肝受损体内部癌治愈的不确定靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确立为的调节HCC组织糖酵解的关键问题问题
02、YBX1驱动HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能量转换基础代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1加快HCC中的有氧糖酵解和增值
03、OGT与YBX1紧密联系并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,血清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密结合并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化明显增强其磷过酸,最后加速其核转位
进一点检验YBX1的O-GlcNAc糖基化是否能够直接影响其磷碱化,在OGT敲低的HCC体肿瘤细胞中或用OGT遏药物OSMI-1进行补救,YBX1淀粉酶技术明显性减小,YBX1磷碱化明显性缩减(图4A-C)。IP实验操作提示 ,在相等的Flag-YBX1底物技术下,YBX1-WT的磷碱化技术明显性如果超过YBX1-T57A,证明磷碱化的增高不单仅是而是极高的YBX1淀粉酶展示(图4D)。剥离 了核和质类物质出现TMG进行补救的HCC体肿瘤细胞中YBX1核展示的提升(图4E-F),进一点出现YBX1磷碱化的重点调接要素是AKT(图4G-I)。这部分出现注重O-GlcNAc糖基化进行有助于其磷碱化来明显增强YBX1淀粉酶稳定的性并有助于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖影响于其进那步会发生磷酸性反应掩盖并都可以加速其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 要能加强组血清乳酸性反应掩盖情况
分析表明YBX1敲低取得有效减低淀粉酶质乳碱化,特别是是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解仰溶液剂2-DG的进行实验断定了糖酵解与组淀粉酶乳碱化的随时绑定,仰制糖酵解可取得有效减低H3K18la层次(图6D)。PKM2过表答方法不可逆转转YBX1敲低可致的H3K18la上升,到外源乳酸解决不单大幅提升H3K18la,还伴着YBX1表答方法上浮,提示信息存有朝反映(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la能够 丰度于YBX1起动子随时力促其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化管控(图6H-J),并表明P300 上浮是YBX1明显增强H3K18乳酰化为用的体系(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳碱化遮盖水平面
内容工作小结
在这方面科学研究中通讯稿了YBX1在HCC中高抒发,有时候与糖酵揭秘切想关。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,最后动态平衡淀粉酶质并新增其抒发。这些淡化还利于YBX1在T57处的磷硝化作用,利于其核易位。故此,相应全过程增强学习了糖酵解想关DNA的转录并激励乳酸的形成。还有,YBX1成功激活P300的转录,以致驱使组淀粉酶的乳硝化作用,非常是H3K18la,H3K18乳硝化作用正面改善YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传病正负极馈环长效机制图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向治疗势能代谢转化组技术服务,拜谱微生物建立了完善成熟的转录组学、球蛋白组学、翻意后突显组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考生文献资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.