草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿设计里种类的病症中的一个。肾机构中CaOx结晶过呈现饱和状态的堆积会得以引起肾小管肿瘤细胞软组织损伤和凋亡，得以得以引起肾结石的建成。短链人体脂肪酸酸由胃肠胃内厌氧食物发酵杆菌食物发酵伙食弹性纤维引起，并不是在局布胃肠胃天然屏障中推动出效用，同时还在设计技术上也推动出关键性效用。至少，丁酸是最多的短链人体脂肪酸酸，具备抗体克制和抗体克制效用,本调查研究丁酸对CaOx肾结石的效用和存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院口腔科泌尿整形科吴忠客座教授、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠硕士生导师、周子健博士生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱微生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了电脑网络药剂学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

散文名稱：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 企业客户的单位：华山宠物医院 探讨相亲对象：大鼠、HK-2体细胞 分组名信息：剖析组（Con）、类别组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提高枝术：网路临床药理学检侧

想法步骤图

研究探讨最终结果

实验人工最先营造大鼠三维3d型号，确认身理什么是生化公式和组织性病理学学染色法等实验伎俩显示丁酸也可以减轻CaOx三维3d型号大鼠肾CaOx氯化钠晶体的产生和挫伤，有效改善CaOx三维3d型号大鼠的感染挫伤和氧化反应的化学物质的优化体现。不仅而且，丁酸还可控制草酸帮助的HK-2人体细胞核挫伤、氧化反应的应激状态和人体细胞核凋亡。 为探求丁酸框架和靶遗传人类染色体网上，探索成员从PubChem获取一个丁酸和丁酸酯的二维和三维空间框架（图1A）。借助PharmMapper的资料表格库和Uniprot的资料表格库办理后共淘汰出119个丁酸靶遗传人类染色体供进步了解。将遗传人类染色体列表框加入STRING的资料表格库，来进行PPI网上了解。Cytoscape做出了编排的前20的交通核心区靶遗传人类染色体的详尽网上图，收录CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。哪些交通核心区遗传人类染色体与网上中的的遗传人类染色体均展现出固定的有关的信息性，反映哪些遗传人类染色体可能性起着着协同工作做用。GO和KEGG了解蕴含了丁酸交通核心区遗传人类染色体的有关的信息路线和动物学的功能（图1C）。交通核心区遗传人类染色体一般与类固醇性的激素对答、腐蚀应激响应效应对答、灵抗逆性氧体细胞对类固醇性的激素兴奋的效应已经对咸性有机化学物资的效应有关的信息。以上指出，哪些交通核心区遗传人类染色体一般参与的了腐蚀应激响应效应和对灵抗逆性氧的动物效应期间，是肾结石产生规则中根本性的路线，这表达丁酸可能性在肾结石中起着根本性做用。

图1| 丁酸的结构与靶什么是基因在线深入分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进那步经历丁酸对CaOx肾结石不容置疑切靶染色体遗传，探究工作员充分利用GEO信息资料库对GSE73680中建康比较与CaOx肾结石求美者的染色体遗传对比科学设计实行了探究。比较组与CaOx结石求美者的取得性对比科学设计表述染色体遗传（DEGs）表观遗传检测准则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个染色体遗传出现取得变化规律，在当中3379个（89.4%）染色体遗传表述上涨，404个（10.6%）染色体遗传表述上涨（图2A）。对DEGs实行聚类算法科学设计法科学设计，热图提示了前10个被选中DEGs的二维分类聚类算法科学设计法结构特征（图2B）。陆陆续续，探究工作员在GeneCards信息资料库劳动力亲子鉴定了370个或者与CaOx肾结石有关系的染色体遗传，排列前20位的分析预测染色体遗传下列关于有关系性得分长为2C如图是。关健在于寻到丁酸医疗CaOx肾结石的关健靶点，探究工作员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关系染色体遗传净化处理赢得了个Venn图。决定性，CYP2C9被判别为丁酸直接影响CaOx肾结石的风险靶点(图2D)。不仅而且，探究工作员还实行了丁酸与CYP2C9的分子结构交接，CYP2C9的八个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸共同目的，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在采用网咯药学学预測CYP2C9是丁酸导致CaOx肾结石的靶dna后，的研究师还完成神经细胞核实验操作灵魂存在了CYP2C9可削减草酸诱骗的HK-2神经细胞核的ROS关卡、宫颈炎症受损和凋亡。

图2| 半数以上据库联办解析估计CYP2C9是丁酸用途于CaOx肾结石的靶dna

探索最后

本学习先是认为丁酸在身体之外和身体内部均能限制CaOx肾结石型号的阳极氧化的应激性反应和支原体感染受损，马上又经由电脑网洛药理学学学建立得到了丁酸影向CaOx肾结石的内在的靶点——CYP2C9，结尾经由細胞工作印证CYP2C9在草酸盐介导的HK-2細胞ROS的水平、支原体感染受损和凋亡。这种认为认为丁酸已经经由限制CYP2C9来限制CaOx肾结石的阳极氧化的应激性反应，改善支原体感染受损。这全过程中拜谱微菌物提供数据了电脑网洛药理学学学技巧工作，还有就是拜谱微菌物可改善成熟稳重建立完善的人类基因组学、蛋白酶质组学、细胞代谢组学等几组学车辆及技巧工作，认可咨询公司咨询公司！ 参看专著：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.