N6-甲基腺苷（m6A）是真核微菌物mRNA中最猛要的转录后修饰语，在真核微菌物的病症和生理性具体步骤中起着至关必要的角色。血糖值高的认识程度缺陷都是种不不可逆转的中枢神经软件系统神经软件系统软件系统退行性急病，现在发展趋势不容置疑切工作机制还没完整展现，以及存在能够的预放和治療的方法。

2024年2月6日，北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生态学为其提供m6A甲基化数据分析技艺业务，为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

论文名字大全：Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice（Int J Mol Sci.，IF=6.2，2024.2）

潜在客户厂家：北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

研究探讨相关材料：小鼠脑组织

拜谱具备技术性：m6A甲基化（MeRIP-seq）

引言图：

图1| 提要图(图源：Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

实验結果

1.DCI小鼠海马中m6A人类基因绘制的改善

探索人工一开始确立了高脂生活和的了解困难（DCI）的小鼠整治。为对比照表组(n = 3)和DCI组(n = 3)两者之前的m6A染色体遗传遮盖，探索人工应用MeRIP-seq来进行了转录组领域内的m6A-seq介绍。在DCI组的10664个商品编码染色体遗传转录物(mRNAs)共产党得知照表组的23713个不相同的m6A峰。相比较之外，DCI组呈现出23,753个非相同m6A峰。在这当中，9349个甲基化染色体遗传在照表组和DCI组两者之前相同(图2)。

图2| 相较比较组和DCl组m6a呈现表观遗传的维恩图

共检验出12715个与众有差异 之处甲基化的m6A位点(DMMSs)，在其中60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化水准分辨可观超过比对组。了解其生长情况报告察觉m6A峰生长在全RNA中(图3A)，并会按照其生长的转录空间分下面的五组：5'UTR、3'UTR、转录起至位点空间场面、中止账户账户登录密码子场面、起至账户账户登录密码子场面和简码回文序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和中止账户账户登录密码子附进可观丰度(图3B)。为了能考核这样什么是DNA上m6A掩盖的空间，研究探讨拜谱生物淘汰了有峰批注的空间，并法测定了这样什么是DNA上reads的网络覆盖范围。在DCI组中，m6A掩盖区偏往于3'UTR区(图3C)。几乎所有mRNA内的DMMS都被市场定位到染色的的体进行考核其生长概述。与众有差异 小鼠染色的的体的m6A掩盖谱与众有差异 。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的变

为了能让考验m6A修饰语在DCI小鼠中的生态学学技能，的研究师从2组任选择含有DMMS的球膳食纤维简码dna参与GO和KEGG研究(图4A)。在GO研究中，高甲基化dna在受损体组织细胞核步骤、生态学步骤国家宏观调控、促使生物酶和杂环氧化物依照中取得丰度。KEGG径路研究界面显示信息，高甲基化dna与T受损体组织细胞核肾上腺素蛋白激酶卫星网络表现径路、小受损体组织细胞核肺腺癌和RIG-I样肾上腺素蛋白激酶卫星网络表现径路涉及(图4B)。我们对低甲基化dna，GO研究界面显示信息在受损体组织细胞核步骤、代谢转化步骤和依照步骤中取得丰度有机质环氧化物、依照杂环氧化物和促使生物酶(图4C)。KEGG径路研究阐明了低甲基化dna与肥厚性心肌病和Hippo卫星网络表现径路的微信关联(图4D)。

图4| 区别甲基化m6A位点的径路聚集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数据源的协力研究

结果科学研究相关人员将m6A MeRIP-Seq的数值和前者RNA-Seq的数值展开共同定量分析，看见163个mRNA，m6A峰和mRNA级别不错变更。41种mRNA的m6A和mRNA级别上浮，14种mRNA级别调低。再者，30个dnamRNA把你想表达出来方式上浮，m6A级别调低，76个dnamRNA把你想表达出来方式调低，m6A级别上浮(图5A)。结果，搭配好几回个PPIwifi网络来显视163个dna编码查询的淀粉酶左右的联接(图5B)。

就像文中6如下图所示，GO和KEGG数据介绍划分为四组：(1) m6A调涨，mRNA降低；(2) m6A调涨，mRNA调涨；(3) m6A降低，mRNA降低；(4) 遗传dnam6A降低和mRNA调涨。在GO数据介绍中，m6A调涨和mRNA降低的遗传dna在上皮細胞膜膜消化吸收具体步骤、香味族有机化合物生态学聚合具体步骤和RNA消化吸收具体步骤的调节作用中有效聚集。KEGG数据介绍体现 ，哪些遗传dna在脂肪多酸酸消化吸收、小上皮細胞膜膜肺肿瘤、丙酸消化吸收和甲苯酸消化吸收中聚集。针对于m6A调涨和mRNA调涨的遗传dna，GO数据介绍体现 在亚铁构建、亚胺丙氨酸脱羧酶催化活力性、天冬氨酸1-脱羧酶催化活力性和上皮細胞膜膜连接方式制造负调节作用中聚集；KEGG数据介绍体现 在2型尿毒症、脂肪多酸上皮細胞膜膜指数公式移动的电磁波环路和胰岛素移动的电磁波环路中聚集。在GO数据介绍中，m6A降低和mRNA降低的遗传dna在寡肽构建、谷胱甘肽构建和二硫防铁的氧化物物防氧化物回归酶催化活力性中聚集，而在KEGG数据介绍中，它们的在柠檬百香果酸配置(TCA配置)、丙酸消化吸收和多外来物种凋亡中聚集。在GO数据介绍中，m6A降低和mRNA调涨的遗传dna在胚胎骨环节型态出现、蛋白酶激酶催化活力性刺激和NADP消化吸收具体步骤中聚集，在KEGG数据介绍中，m6A降低和mRNA调涨遗传dna在新霉素、卡那霉素和神经末梢各种营养成分摄入指数公式移动的电磁波环路中聚集。

图5| m6A甲基化与mRNA表达出的连合研究

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG深入分析

拜谱微生物总结ppt

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变，特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解，可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱海洋生物提供了m6A甲基化技术工艺服务的，拜谱生态学可提供完善成熟的血清组学、新陈代谢组学、转录组学及及两组学协力物品新技术业务，欢迎致电咨询！

参照医学文献：Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.