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首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 新货发部|乳碱化的逆袭女神哥哥,衣康碱化遮盖蛋清组高冷来战!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一只是化工环保原材料而被所知的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄危化物”是“宝藏地方小团伙”的坚辛发展历程类似的,终究会近103年才被知道其主要的生态学学模块,从“平躺农奴把唱歌”,专门是在免疫检测慢性支原体感染性症状探析业务领域内独树一帜。多余数篇研究综述曝光了在各项慢性支原体感染性症状的动物界建模中会给予衣康酸或其化工装饰诞生态学的控制益处,并知道其自身靶点。关羽衣康酸的“今生今世来世”与“今生今世”,详细微信推文《乳酸的逆袭女神朋友——衣康酸!篇文章带你飞学习衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸绘制淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度修饰语位点检测出,增强逆转有趣靶点,全方面生信阐述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发现了”到“认证”全工艺流程服务的,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验操作流程步骤

02、测试数据显示

03、经“点”重新

在评测数据资料中,查出许多论文资料中了解的传统靶点和其衣康酸突显位点,如首要个被察觉到的衣康酸共价突显淀粉酶KEAP1,另外还有糖酵解环路中的3个最为重要的的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,和炎性小体形成淀粉酶NLRP3和肿瘤细胞烂掉过程中 中的最为重要的的淀粉酶RIPK3等,其质谱图下面的图下图。

04、產品优缺点

1.丰富质控

商务化特女性朋友检则器孵育、SDS-PAGE检则、WB确认、子样本有关系性深入分析等各种位检则,确保安全投资项目最后稳定性。

2.高机械性能质谱测试仪器网络平台

在Orbitrap Astral全全新一代名将高辨认质谱仪六道金刚咒下,推动衣康硝化作用掩盖位点及球蛋白签定新长度,助力器学科分析新发掘。

3.全步骤流程站台式服务保障

体系结构拜谱生物体全面的实践机构,可提供了“肿瘤细胞教育培养→电极孵育→WB判断→举重若轻度衣康硝化作用掩盖判断→专业生信了解→目标位点PRM安全验证”全工艺流程服务项目,省时省功更贴心。

05、剖析信息(个部分)

06、采用朝向

PART 2、论文分析

论文参考文献一

英语宝贝标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名网站标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

实验游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文二

英文翻译标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

繁体中文版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究分析东西:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例诞生构思

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具较少的底物结合起来程度,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱动物衣康碱化表达组测试数据库中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸淡化(如表图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

当作TCA反复中的中分解率率物,衣康酸可以调节分解率率、抗体系统和支原体感染之间之间的之间用处,为制疗抗体系统支原体感染性病出具了代换制疗管理策略。衣康酸框架中的亲电性α,β-不饱满羧酸框架能对血清质上的吸附性半胱氨酸残基采取烷基化淡化(迈克尔暴伤想法),某种翻译专业后淡化被叫做“衣康酸淡化(itaconation)”,继而干扰血清质功用,调节作用抗体系统回复和分解率率行业,为很多种病类药物开发出具新方法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化掩盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学专业肯定按量靶向药物消化吸收组(QMT1000)或能量场分泌转化靶点分泌转化组成品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

基准论文资料

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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