
癌症的代谢重编程一直是研究的焦点,然而,代谢如何影响癌症进展尚不清楚。棕榈酸是一种十六碳的饱和脂肪酸,作为脂肪的一个主要组成部分,棕榈酸可为机体提供能量,另一方面,棕榈酸可以参与肿瘤细胞信号传导途径,或者作为蛋白棕榈酰化的底物,影响多个细胞信号分子的功能。2023年3月7日,中山大学医学院附属第六医院兰平教授团队在Cell Discovery上在线发表了题为“Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression”的文章,该研究发现代谢酶酰基辅酶 A 氧化酶 1 (ACOX1) 通过调节棕榈酸 (PA) 重编程来抑制结直肠癌 (CRC) 进展。ACOX1是一种肿瘤抑制因子,其下调会增加PA介导的β-catenin棕榈酰化和稳定性,并过度激活β-catenin信号传导,从而促进CRC进展。这一发现揭示了一个全新的治疗途径,即通过靶向β-catenin棕榈酰化,为未来的癌症治疗提供了宝贵的线索。
英文版题目:Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression(Cell Discovery,IF=38.09,2023)
中文名宝贝标题:ACOX1去磷酸化诱导的棕榈酸重编程促进β-catenin棕榈酰化,从而驱动结直肠癌进展
范例类:临床癌和癌旁组织、HEK293T细胞
想关组学技术性:定量蛋白组、S-棕榈酰化修饰组
一、基本学习可是
1.ACOX1 下跌并与 CRC 进行相应
要知道在结结肠良性良性肿瘤突发中激发关键性的功效的分解基础基础代谢率转化一些染色体,小说作者对存在有差异 数据文件文件集的每组1000个CRC中2751个分解基础基础代谢率转化一些染色体的转录级别实行了介绍,其中包括癌症复发染色体组图谱(TCGA) CRC RNA-SeqV2、TCGA CRC RNA -Seq和染色体表明融合(GEO)。不仅,还对存在临床医学药理蛋清质组良性良性肿瘤介绍联盟官网 (CPTAC) 数据文件文件集和本调查中的临床医学药理样板按量质谱 (MS) 的每组100个CRC中的这种分解基础基础代谢率转化一些染色体的蛋清质级别实行了介绍。进行重重叠叠介绍采用了 CRC中看起来转变的 11 个分解基础基础代谢率转化一些染色体(图 1)。主要比喻,ACOX1是主要的分解基础基础代谢率转化限速酶,被检测使用于事件介绍(图1)。
图1 ACOX1调低并与CRC进况相应的(图源:Zhang et al., Cell Discovery, 2023)
2. ACOX1短缺可不稳定性 β-catenin并使用PA减弱其转录吸附性
想要探险ACOX1调结的CRC关于的神经元警报做好,在TCGA参数比对库做好了表观遗传集生物富集分折 (GSEA)。GSEA 凸显ACOX1与Wnt警报做好负关于的。与此同一,公用设施参数比对库ACOX1级别较低的肿癌机构和移转样板中β-catenin靶表观遗传上浮,这在神经元调查中得以进一大步否认。虽然,在神经元青春潜能测试调查中察觉到,ACOX1的无限紧张呈现控制了CRC神经元的青春潜能,而β-catenin的无限紧张呈现还可以挽回这样情况下,进一大步研发察觉到ACOX1变动可实现PA稳定性 β-catenin血清,因此提升其转录化学活化(图2)。
图2 ACOX1的缺损可平稳β-catenin并根据PA加强转录活性氧(图源:Zhang et al., Cell Dis
3. PA介导的β-catenin棕榈酰化治理和改善β-catenin的泛素化吸附
事先的深入分析认为,PA是核球核蛋白质含量酶质棕榈酰化的底物,同时核球核蛋白质含量酶质棕榈酰化是可不可以影响核球核蛋白质含量酶质-核球核蛋白质含量酶质充分用。本深入分析中,内源性β-catenin的棕榈酰化在HEK293T内部中达到灵魂存在。PA 和棕榈酰化压药品2-溴棕榈酸酯 (2-BP)分离加强和压制了β-catenin在466位半胱氨酸的棕榈酰化体现。2-BP棕榈酰化的压制也缩减了β-catenin的丰度,并推动β-catenin多泛素化(图3)。许多的数据认为,β-catenin核球核蛋白质含量酶的动态平衡性是可不可以按照最新科技棕榈酰化体现来改善。
图3 PA介导的β-catenin棕榈酰化可治理和改善β-catenin的泛素化(图源:Zhang et al., Cell
4. 物种进化结阑尾癌中的DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴失常
要判定CRC中DUSP14、ACOX1 和β-catenin间的想关性,作著对社会球蛋白酶质图谱(HPA)数剧集中式的自动匹配我们模本进行了监床模本的免疫细胞组识物理,并验正了 ACOX1 和 DUSP14 间的负想关性与 ACOX1 和 β-catenin间的负想关性。作著知道 DUSP14-ACOX1-β-catenin 轴在较早 CRC 中失常。要非常好地验正这样关注后果,回收利用了24个较早 CRC 模本 (T) 与相邻的健康小肠组识 (N)。这样的CRC模本中 ACOX1 球蛋白酶取得缩短,而 DUSP14 和 β-catenin 取得增高(图 4)。不但,DUSP14与ACOX1、ACOX1与β-catenin间的负想关性与β-catenin与DUSP14间的正想关性也在CRC模本中实现进一部验证(图4)。与此同时所论,DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴在CRC进步中起着至关重点的效用,还 Nu-7441能进行能够抑制 DUSP14-ACOX1-PA变成 冶疗CRC 的存在策略性。
图4 科学家CRC中DUSP14-ACOX1-PA-β-catenin轴的絮乱(图源:Zhang et al., Cell
二、个人心得体会
排泄物能上下调整核核苷酸的讲述后绘制,如PA能绘制核核苷酸棕榈酰化,上下调整核核苷酸能力。本设计感觉半个种新的β-catenin核血清绘制——棕榈酰化,或棕榈酰化上下调整β-catenin安全稳判定的制度,这摄入了咱们对有趣β-catenin核血清表现进行的熟悉。三、拜谱总结ppt
棕榈酸 (PA) 是一种ACOX1底物和高脂肪饮食中的主要脂肪酸,已被证明可以产生能量并调节参与癌症发展的细胞内信号分子。PA 可以在棕榈酰化过程中修饰半胱氨酸残基。越来越多的证据表明,蛋白质(如 PDL1、GULT1、STAT3 和 IFNGR1)的棕榈酰化会影响蛋白质功能和肿瘤进展。拜谱生物作为一家国内领先的多组学公司,在棕榈酰化修饰积累了丰富的项目经验,并已完成半胱氨酸修饰蛋白质组学产品的全面升级,助力Nature文章发表,现可提供棕榈酰化、亚硝基化、谷胱甘肽化、次磺硝化作用、硫巯基化、Total 氧化物替换、悬浮巯基蛋白质组学拜谱生物,欢迎大家咨询!
选取毕业论文:
Zhang Q, Yang X, Wu J, Ye S, Gong J, Cheng WM, Luo Z, Yu J, Liu Y, Zeng W, Liu C, Xiong Z, Chen Y, He Z, Lan P. Reprogramming of palmitic acid induced by dephosphorylation of ACOX1 promotes β-catenin palmitoylation to drive colorectal cancer progression. Cell Discov. 2023; 9(1):26. doi: 10.1038/s41421-022-00515-x.